A AMMT possui dois representantes atuando como conselheiros no Conselho Regional de Medicina de Mato Grosso (CRM-MT), dentre eles Willian Ricardo Camarço da Silva, que esclarece que a indicação de dois membros da Associação é determinada por lei federal desde 1957.

Atuam em conjunto com os outros conselheiros no sentido de zelar pelo bom exercício da Medicina. Participam das câmaras de julgamento de sindicâncias e plenárias de julgamento e também ministram aulas de ética médica nos cursos dirigidos aos alunos do 5º e 6º anos das faculdades de Medicina do Estado.